Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSI1O43347 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MSI1O43347 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MSI1O43347 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSI1O43347 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSI1O43347 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSI1O43347 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSI1O43347 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MSI1O43347 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSI1O43347 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MSI1O43347 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSI1O43347 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MSI1O43347 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MSI1O43347 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MSI1O43347 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSI1O43347 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MSI1O43347 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSI1O43347 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MSI1O43347 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MSI1O43347 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MSI1O43347 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MSI1O43347 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSI1O43347 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MSI1O43347 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MSI1O43347 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms