Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP3O43295 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRGAP3O43295 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRGAP3O43295 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms