Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 DYNC1LI2-205ENST00000563628 355 ntTSL 51.18□□□□□ -2.224e-16■■■■■ 31.1
RBFOX2O43251 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)13.46□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 31.1
RBFOX2O43251 TMC8-207ENST00000591144 772 ntTSL 315.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31
RBFOX2O43251 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 31
RBFOX2O43251 TMC8-202ENST00000589691 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 31
RBFOX2O43251 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 39.25□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 31
RBFOX2O43251 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 31
RBFOX2O43251 GIPR-206ENST00000591224 782 ntTSL 213.02□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 31
RBFOX2O43251 TSC2-221ENST00000568366 767 ntTSL 413.35□□□□□ -0.274e-9■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 HEXDC-210ENST00000582131 942 ntTSL 519.3■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SLC39A11-205ENST00000579319 439 ntTSL 38.74□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SLC39A11-211ENST00000581581 386 ntTSL 34.53□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 OSMR-205ENST00000513831 766 ntTSL 38.04□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 C15orf39-206ENST00000565074 3152 ntAPPRIS ALT211.71□□□□□ -0.533e-16■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-16■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SH3BP2-203ENST00000442312 9211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.328e-7■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.118e-9■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.58e-9■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.758e-9■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SNHG6-205ENST00000521399 302 ntTSL 215.13■□□□□ 0.011e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.111e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-219ENST00000480929 2421 ntTSL 28.8□□□□□ -11e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.021e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-211ENST00000448224 583 ntTSL 57.77□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-214ENST00000465558 1688 ntTSL 26.17□□□□□ -1.421e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-204ENST00000417196 811 ntTSL 56.12□□□□□ -1.431e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-221ENST00000494428 829 ntTSL 36.03□□□□□ -1.441e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-218ENST00000480472 765 ntTSL 45.65□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-207ENST00000434241 476 ntTSL 55.49□□□□□ -1.531e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 TTLL4-215ENST00000467841 973 ntTSL 45.47□□□□□ -1.531e-8■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 ACAA1-207ENST00000440176 1328 ntTSL 216.49■□□□□ 0.233e-32■■■■■ 30.9
RBFOX2O43251 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 29.67□□□□□ -0.861e-20■■■■■ 30.8
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RBFOX2O43251 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.353e-15■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 26.05□□□□□ -1.443e-15■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 STT3B-204ENST00000453168 1888 ntTSL 1 (best)21.09■□□□□ 0.977e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 STT3B-202ENST00000423527 1664 ntTSL 220.94■□□□□ 0.947e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.247e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 STT3B-205ENST00000462235 801 ntTSL 31.95□□□□□ -2.17e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.156e-13■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC5.23□□□□□ -1.576e-13■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 ANKS1A-202ENST00000470698 957 ntTSL 59.59□□□□□ -0.875e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 210.48□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 TSC2-213ENST00000483020 563 ntTSL 410.28□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 TSC2-212ENST00000471143 577 ntTSL 49.2□□□□□ -0.943e-9■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-214ENST00000544064 577 ntTSL 416.97■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-205ENST00000536793 559 ntTSL 413.9□□□□□ -0.189e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-206ENST00000536956 621 ntTSL 312.07□□□□□ -0.489e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-211ENST00000543468 3722 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.799e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-212ENST00000543523 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.869e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-204ENST00000535752 543 ntTSL 43.27□□□□□ -1.899e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 EPS8-210ENST00000543363 374 ntTSL 42.06□□□□□ -2.089e-8■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 30.8
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RBFOX2O43251 DYNC1LI2-211ENST00000567499 3994 ntTSL 26.06□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)21.37■■□□□ 1.013e-11■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.83e-11■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.443e-11■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.273e-11■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 211.9□□□□□ -0.53e-11■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 GAK-211ENST00000509566 3126 ntTSL 212.22□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 210.21□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MAPK15-206ENST00000484654 2240 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.236e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-209ENST00000562940 1142 ntTSL 1 (best)11.52□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.596e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-213ENST00000566050 1270 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-205ENST00000561522 543 ntTSL 48.82□□□□□ -16e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-215ENST00000567539 556 ntTSL 48.54□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-210ENST00000562994 565 ntTSL 47.65□□□□□ -1.186e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-214ENST00000566469 824 ntTSL 27.1□□□□□ -1.276e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-217ENST00000568798 560 ntTSL 46.77□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 MTHFSD-218ENST00000569000 573 ntTSL 46.18□□□□□ -1.426e-7■■■■■ 30.8
RBFOX2O43251 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-11■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 DOCK1-202ENST00000464466 323 ntTSL 35.88□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.019e-7■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 RAI1-203ENST00000471135 570 ntTSL 310.06□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 PANK4-212ENST00000515423 430 ntTSL 39.1□□□□□ -0.955e-9■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 ZMYND8-210ENST00000446894 341 ntTSL 22.82□□□□□ -1.964e-7■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 WDR90-224ENST00000552943 5498 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 WDR90-221ENST00000552648 905 ntTSL 514.09□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 CSNK1D-212ENST00000580061 578 ntTSL 312.73□□□□□ -0.371e-16■■■■■ 30.7
RBFOX2O43251 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 30.7
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