Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
FANCAO15360 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
FANCAO15360 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
FANCAO15360 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
FANCAO15360 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
FANCAO15360 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCAO15360 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCAO15360 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCAO15360 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCAO15360 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCAO15360 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
FANCAO15360 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FANCAO15360 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FANCAO15360 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FANCAO15360 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
FANCAO15360 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
FANCAO15360 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FANCAO15360 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FANCAO15360 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
FANCAO15360 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCAO15360 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCAO15360 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCAO15360 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCAO15360 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCAO15360 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCAO15360 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCAO15360 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCAO15360 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms