Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF646O15015 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF646O15015 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms