Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IKBKBO14920 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IKBKBO14920 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IKBKBO14920 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms