Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 RFK-202ENST00000472900 753 ntTSL 318.14■□□□□ 0.498e-12■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.348e-12■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 SLC35F5-212ENST00000498768 1711 ntTSL 1 (best)24.32■■□□□ 1.481e-10■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.331e-10■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.691e-10■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 SLC35F5-202ENST00000409106 3120 ntTSL 217.7■□□□□ 0.421e-10■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.845e-9■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.211e-20■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 BAG1-211ENST00000635077 658 ntTSL 322.53■■□□□ 1.21e-20■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 BAG1-208ENST00000488499 485 ntTSL 317.88■□□□□ 0.451e-20■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 BAG1-203ENST00000379707 1396 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.331e-20■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.271e-20■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 AFG3L2-203ENST00000590811 627 ntTSL 317.4■□□□□ 0.383e-13■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.536e-7■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.046e-7■■■■■ 43.2
DDX3XO00571 DBF4-202ENST00000413643 2694 ntTSL 1 (best)22.47■■□□□ 1.191e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 DBF4-204ENST00000431138 2342 ntTSL 1 (best)14.39□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 DBF4-206ENST00000495067 797 ntTSL 211.17□□□□□ -0.621e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 DBF4-205ENST00000486925 574 ntTSL 210.71□□□□□ -0.691e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.023e-15■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.093e-15■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.419e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.329e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.299e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 PPP2R5D-201ENST00000230402 2958 ntTSL 213.94□□□□□ -0.189e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 PPP2R5D-203ENST00000461010 1558 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.729e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.181e-15■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.937e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-203ENST00000524704 584 ntTSL 218.92■□□□□ 0.627e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-214ENST00000532544 580 ntTSL 318.37■□□□□ 0.537e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-210ENST00000529277 582 ntTSL 517.87■□□□□ 0.457e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.37e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 GALM-203ENST00000427858 597 ntTSL 415.5■□□□□ 0.071e-11■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-207ENST00000525898 1405 ntTSL 515.43■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-205ENST00000525210 468 ntTSL 415.26■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-208ENST00000526958 538 ntTSL 413.72□□□□□ -0.217e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.31e-11■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 AMHR2-207ENST00000553037 608 ntTSL 412.48□□□□□ -0.413e-18■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD82-209ENST00000527737 654 ntTSL 311.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 GALM-201ENST00000272252 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-11■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.364e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-217ENST00000469377 3151 ntTSL 26.54□□□□□ -1.364e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.444e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.544e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.584e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.664e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.664e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.694e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.714e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.764e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.774e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.84e-9■■■■■ 43.1
DDX3XO00571 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.452e-27■■■■■ 43
DDX3XO00571 CD63-203ENST00000546457 607 ntTSL 214.46□□□□□ -0.092e-27■■■■■ 43
DDX3XO00571 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.112e-27■■■■■ 43
DDX3XO00571 LRFN3-203ENST00000587257 529 ntTSL 414.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 43
DDX3XO00571 LRFN3-202ENST00000585876 558 ntTSL 412.09□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 43
DDX3XO00571 PIGX-208ENST00000457284 523 ntTSL 213.07□□□□□ -0.328e-9■■■■■ 43
DDX3XO00571 PIGX-207ENST00000453218 1068 ntTSL 513.07□□□□□ -0.328e-9■■■■■ 43
DDX3XO00571 PIGX-204ENST00000421265 677 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.978e-9■■■■■ 43
DDX3XO00571 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.468e-9■■■■■ 43
DDX3XO00571 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.658e-9■■■■■ 43
DDX3XO00571 HMGN4-202ENST00000477243 113 ntTSL 33.28□□□□□ -1.885e-32■■■■■ 43
DDX3XO00571 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.44e-19■■■■■ 43
DDX3XO00571 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.213e-9■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 GALNT1-202ENST00000586725 272 ntTSL 513.9□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.652e-14■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.512e-14■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-202ENST00000517682 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.776e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.876e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.876e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-207ENST00000522934 562 ntTSL 49.17□□□□□ -0.946e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-206ENST00000520517 566 ntTSL 47.65□□□□□ -1.186e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-209ENST00000523016 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.336e-35■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 USP33-212ENST00000524778 389 ntTSL 520.71■□□□□ 0.912e-12■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 USP33-213ENST00000525113 497 ntTSL 318.37■□□□□ 0.532e-12■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 USP33-215ENST00000528150 500 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-12■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-12■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.322e-12■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.576e-9■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.589e-11■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 GPR160-209ENST00000492492 1299 ntTSL 1 (best)19.96■□□□□ 0.799e-11■■■■■ 42.8
DDX3XO00571 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.97e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.067e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.977e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.867e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.677e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.627e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 524.75■■□□□ 1.557e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.527e-11■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CLPP-203ENST00000596070 1346 ntTSL 516.05■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 CLPP-202ENST00000594780 1007 ntTSL 213.71□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 42.7
DDX3XO00571 SEPT7-219ENST00000635476 506 ntTSL 523.37■■□□□ 1.337e-8■■■■■ 42.7
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