Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLIM4O00461 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLIM4O00461 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLIM4O00461 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLIM4O00461 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLIM4O00461 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLIM4O00461 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms