Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC7O00311 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC7O00311 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC7O00311 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC7O00311 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDC7O00311 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC7O00311 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC7O00311 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC7O00311 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC7O00311 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms