Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BNX3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BNX3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BNX3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BNX3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H3BNX3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3BNX3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3BNX3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3BNX3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3BNX3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
H3BNX3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H3BNX3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3BNX3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3BNX3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3BNX3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms