Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PMD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PMD0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PMD0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PMD0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PMD0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PMD0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PMD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PMD0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PMD0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
E9PMD0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
E9PMD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
E9PMD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
E9PMD0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
E9PMD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
E9PMD0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
E9PMD0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PMD0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PMD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PMD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PMD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
E9PMD0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
E9PMD0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms