Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP99D6REC4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP99D6REC4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms