Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SRRM5B3KS81 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRRM5B3KS81 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms