Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VGLL3A8MV65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VGLL3A8MV65 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms