Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
YJEFN3A6XGL0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
YJEFN3A6XGL0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms