Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF233A6NK53 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF233A6NK53 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF233A6NK53 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms