Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C5orf60A6NFR6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C5orf60A6NFR6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C5orf60A6NFR6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms