Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC182A6NF36 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCDC182A6NF36 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms