Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM247A6NEH6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM247A6NEH6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms