Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00862A6NCI5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00862A6NCI5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms