Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MAP1LC3B2A6NCE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms