Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIPSLA2A3N6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PIPSLA2A3N6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms