Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM223A0PJW6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM223A0PJW6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms