Protein–RNA interactions for Protein: A0A539

TCRBV7S3A2, T-cell receptor beta variable 4-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV7S3A2A0A539 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TCRBV7S3A2A0A539 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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