Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YXV3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YXV3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms