Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF24Q9UPV7 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms