Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CCDC88CQ9P219 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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CCDC88CQ9P219 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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