Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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FOXQ1Q9C009 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXQ1Q9C009 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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