Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOL6Q9BWW8 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms