Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms