Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ATP2A3Q93084 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ATP2A3Q93084 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
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