Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC84Q86UT8 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms