Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPPQ6IPU0 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms