Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CCDC96Q2M329 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CCDC96Q2M329 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CCDC96Q2M329 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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