Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HERC3Q15034 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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