Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDC42EP1Q00587 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms