Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 UBTF-206ENST00000527034 3010 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ZNF140-202ENST00000355557 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CPT1A-205ENST00000539743 2382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 KDM2B-219ENST00000611216 3434 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RPL23P62829 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms