Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
LINC01547P58512 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms