Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CASP9P55211 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CASP9P55211 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CASP9P55211 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CASP9P55211 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms