Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK8P49336 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK8P49336 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK8P49336 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CDK8P49336 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms