Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGAEP38570 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGAEP38570 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.7 ms