Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GTF2E1P29083 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms