Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP4AP20648 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms