Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
XBP1P17861 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms