Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SCN2BO60939 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SCN2BO60939 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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