Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GIT1Q9Y2X7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms