Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACAP3Q96P50 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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