Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 CPT1C-217ENST00000598293 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CHAMP1Q96JM3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms