Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC96Q2M329 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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