Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GAPVD1Q14C86 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CA6-201ENST00000377436 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 CA6-202ENST00000377442 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC022121.1-201ENST00000484584 579 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GAPVD1Q14C86 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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